很多工厂对不合格管理各有不同，ISO9001质量体系对不合格的管理也是分类进行，如：
采购不合格，采购部在采购时发生错误，而采购为其它物料时，应由采购部与供应商联系，商
议退货处理。
进料检验不合格，公司品管部IQC对供应商来料进行检验，如最终判定该批物料不合格时，贴上红色REJ标贴，通知采购部及仓库进行退货处理。(具体见<<进料检验控制程序>>)。
如供应商不合格品因某些原因留于公司内部时，仓库应对该些产品进行隔离处理，防止不合格品流入生产现场。
过程巡检不合格， 生产过程中品管部IPQC对整个生产工序进行巡回检验，如发现不合格时，应立即通知有关负责人进行控制，防止不合格品继续发生。 品管部IPQC将在巡检时发现的不合格，填写<<纠正、预防措施单>>要求有关部门进行整改，并将改正措施填上交回品管部IPQC跟踪。
生产过程不合格， 生产过程中因操作者或其它原因造成批量不合格时，应进行返修，如不能返修时，必须进行报废处理。不合格处理方式同本文，生产过程中发现的单一不合格品应与合格品有效的隔离。
成品检验不合格， 品管部FQC在检验时发现不合格品时，首先FQC应将不合格品贴上不合格标贴进行严格隔离,然后应将该不合格品返回生产线返修或拆卸使用，同时，应于不合格周转箱上或摆放位的明显位置贴上不合格标贴，同时注明不合格名称，当不合格品返修好时，该不合格品直接流通于生产线上再进行重检。成品检验发现的不合格品如必须拆卸使用或报废时，应按本文件4.3.2 进行处理。
仓储复检不合格， 仓储过程中因存储条件、存储周期等因素的影响而导致材料批量失效，经品管部IQC 定期复检或仓库管理人员发现不合格时，应填写<<不合格品记录表>>交与总经理裁定最终处理方式。
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